В настоящее время учредителем музея является муниципальное образование «Верхнетоемский муниципальный район».

С 2010 по 2018 годы Верхнетоемский краеведческий музей размещался в двух зданиях по адресу: ул.Ломоносова, д.1 и ул. Кулижского, д.1а.

В здании по улице Ломоносова располагались администрация музея, фондохранилище, выставочный зал. Во втором здании на улице Кулижского располагается постоянная экспозиция.

В 2018 года музей съехал из здания по ул. Ломоносова. С этого времени помимо здания на ул. Кулижского у музея появилось еще два. По адресу Советская, 1а располагается администрация музея. По адресу Советская, 1 - выставочные залы и фондохранилище.

 

Фонды Верхнетоемского краеведческого музея насчитывают более 25000 тысяч музейных предметов.

Основными в собрании музея являются коллекции:

- археологическая,

- нумизматическая,

- этнографического дерева, редких книг, одежды и тканей,

- минералогическая.

Коллекции  муниципальных музеев  отображают особенности  местной истории и культуры дней, глубину времени и драматизм его судьбы.